与首都师范大学合作的小立碗藓高通量测序数据分析文章发表在BMC Plant Biology,影响因子4.09，题目为Genome-wide transcriptome analysis ofgametophyte development in Physcomitrella patens。 

文章摘要：

 

 背景：

 

    基因表达调控在多细胞植物发育过程中起着关键性的作用。本研究的主要目的在于阐述植物发育阶段转变及细胞命运决定的生物学机制。由于小立碗藓生命周期短且结构简单，选择它为研究对象，并设置不同的发育阶段及组织类型，做全基因组表达谱分析。

 

结果：

 

    采用数字基因表达标签序列法检测小立碗藓的表达谱。样本为3，14，24天丝状体，30天叶芽组织，以及14天组织。结果共检测到4333个差异表达基因，其中4129个发育相关特异基因、423个绿线菌 or原丝分枝体组织特异表达基因。GO功能分析发现，大部分的差异表达基因参与有机物代谢或大分子生物合成及催化相关功能。除此以外，一些候选基因可能参与控制发育阶段转变及细胞分化，比如：Myb-like,HB-8,AL3,锌指蛋白家族，Bhlh 超家族，GATA 超家族，GATA以及Bzip 转录因子，蛋白激酶。还有些基因参与蛋白/氨基酸甲基化，激素、乙烯、激动素信号通路等。

 

 结论：

 

   通过对以上检测的在小立碗藓发育阶段差异表达的基因的功能进行进一步的分析，有助于研究植物进化及发育相关机制