第二期—GA专题
【师资介绍】
钟扬教授——复旦大学生命科学学院常务副院长，为您生动讲述生物信息学前沿技术
教授，日本国立综合研究大学院大学生物系统科学博士。中国生物物理学会生物信息学与理论生物物理专业委员会主任委员。主要研究领域为分子进化和生物信息学。近五年来共发表学术论文70余篇，其中SCI核心期刊60余篇。2000年起任复旦大学生命科学学院教授, 植物学和生物信息学博士生导师。兼任上海生物信息技术研究中心副主任和“科学通报”特约编辑等职。
刘雪燕——Illumina公司市场部经理，为您详细阐述GA原理
王珺——英国University of Dundee博士，利用实验设计方面的丰富经验为您讲解GA测序实验操作
负责浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院高通量测序平台建立和数据分析。自测序平台建立以来，已针对肝癌、胃肠癌成功开展了基因组重测序、全新基因组测序、mRNA测序、ChIP-Seq、miRNA测序、多样本混合测序等多项研究。
曾华宗——复旦大学博士，为您详述GA数据分析原理及操作
复旦大学生物信息学博士。五年生物信息学背景，以第一作者或通讯作者发表过多篇高质量的生物信息学文章，现担任上海敏芯信息科技有限公司总经理。对GA在表达谱、microRNA、转录本及CHIP等方面的应用积累了丰富的经验。
刘极龙——技术总监，指导学员进行基因组学、转录组学和生物信息学数据分析和实践
厦门大学博士。具有独立开发的高通量测序数据分析pipeline。可以分析microRNA-GA、mRNA-tag-GA、ChIP-Seq和RNA-seq等数据类型。擅长不同来源的数据的整合分析以及基因网络分析。可以对高通量测序数据进行深度挖掘，从而为实验提供指导。
敏芯Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序培训班
为促进GA高通量测序技术在国内各个研究领域的应用，上海敏芯信息技术有限公司联合Illumina公司和上海明烨生物技术有限公司于2009年6月中旬共同举办Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序技术培训班，为广大科研工作者提供Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序技术的原理、应用实例和实验设计思路、尤其是后期的数据分析等方面的培训。
培训包括两个模块：模块1课堂讲解（2009年6月11日)
模块2上机实践（2009年6月12日）
时间：2009年6月11-12日（2天）
费用：1500元/人（学生1200元/人）（含资料及培训期间的午餐，请自带笔记本电脑）。
培训地点：上海市人才服务中心杨浦中心（杨浦区淞沪路605号）
住宿：主办方协助安排入住如家快捷酒店上海江湾体育场店
（距培训地点步行仅2分钟，杨浦区政立路281号），费用自理（约120元/天）
联系人：021-55666042（office）021-55666042（fax）
报名方式：1.网上报名
2.请参加培训的人员将“培训班报名回执”填写完毕，发送到
sensichip@sensichip.com.cn
注明“GA培训”，或传真至021-55666042（ 9：30-17：30）
主办单位：上海敏芯信息科技有限公司
协办单位：Illumina公司，上海明烨生物科技有限公司
Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序培训班课程表
（2009年6月11-12日）
课堂讲解：
上机实践：
【Solexa高通量测序技术应用】
1、测序与重测序
无论您需要测定的是整个基因组的序列还是基因组上一个大片断候选区域的序列， Illumina Genome Analyzer系统都是当今世界上最先进、最经济的平台。Solexa测序技术和可逆中止化合物染料（reversible terminator chemistry）奠定了在下一代测序技术中高质量、高通量、低成本数据产出的基础。
2、表达谱分析
通过对样本中数以百万计的cDNA标签同时进行序列测定，Genome Analyzer系统可以使您对整个转录组进行数字化的分析，而成本仅仅维持在与目前其他模拟化分析技术同样的水平。由于我们的技术无需利用任何转录子特异性杂交探针，您可以同时进行全基因组转录子的发掘与定量分析，而无需事先知道基因组的注释情况。
3、小RNA鉴定与定量分析
Solexa高通量测序技术可以提供一套全新独特的，适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析研究平台。通过大量的平行测序，研究人员可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱。应用这种低成本快速测定数百万标签序列的新方法，Illumina Genome Analyzer提供了解密小RNA图谱独一无二的方法。
4、定向基因区域重复测序——判定和发现新的基因多态性，如SNP
5、基因组甲基化分析
6、核酸和蛋白相互作用及定位研究，如ChIP-Seq研究
7、宏基因组测序
Meta-Genomics DNA测序是基于新一代测序仪Illumina Genome Analyzer对特定环境微生物种群全基因组DNA研究技术。该方法的特点是在提取微生物种群的DNA后，制备DNA文库进行高通量的测序，可以从整体上对样品群落进行分析，不受微生物是否能培养的限制，而且研究对象从单一基因组到一个基因组集合，也摆脱了对于传统基因组研究的物种限制，开辟了微生物群体基因组学研究的新路径。
