16srDNA测序
16s/18s 2024-05-15 16:24
16SrDNA测序
16SrDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，具有10个保守区域和9个高变区域，其中保守区在细菌中差异不大，高变区具有属和种的特异性，对16SrDNA某个高变区进行测序，用于研究环境微生物中细菌或古菌的群落多样性。
细菌或原核生物16S rRNA
细菌核糖体RNA（rRNA）有三种类型：5S rRNA（120bp）、16S rRNA（约1540bp）和23S rRNA（约2900bp）。5S rRNA基因序列较短，包含的遗传信息较少，不适于细菌种类的分析鉴定；23S rRNA基因的序列太长，且其碱基的突变率较高，不适于鉴定亲缘关系较远的细菌种类；16S rRNA普遍存在于原核细胞中，且含量较高、拷贝数较多（占细菌RNA总量的80%以上），便于获取模板，功能同源性高，遗传信息量适中，适于作为细菌多样性分析的标准。
16S rRNA编码基因序列共有9个保守区和9个高可变区。其中，V4-V5区其特异性好，数据库信息全，适合细菌多样性的分析注释。
沪公网安备 31010702007149号